Будучи одним из тех ребят, кто с самого начала решительно настроен делать то, что любит, Яннис Михаилидис уже в пять лет увлекся футболом. И, конечно же, он уже больше никогда не оглядывался назад.

Воспитанник спортивной академии Яница, родился 18 февраля 2000, прошел все возрастные категории и в 16 лет стал игроком ΠΑΟΚ. Сравнительно взрослый для академии ΠΑΟΚ, однако с впечатляющими перспективами, чтобы остаться «невостребованным». Из Яницы в Салоники, а затем из семейного очага в дом академии ΠΑΟΚ. Трудный переход вначале, как он сам признается, в основном, из-за интенсивных тренировок и учебы в школе, но это нисколько не повлияло на его производительность на стадионе.

Яннис Михаилидис, хоть и опорный полузащитник до этого, сразу сделал ощутимым свое присутствие в линии обороны U-17. Стоппер с впечатляющими соматометрическими данными, высокий, сильный, умный, результативный с задатками лидера. Левша, прекрасно обращается с мячом, выделяется точными длинными передачами и зрелой игрой.

Сыграв насыщенные сезоны, сперва в U-17, а затем в U-19, он праздновал вместе со своими партнерами по команде три чемпионских титула подряд (2017-18, 2018-19, 2019-20), невероятную беспроигрышную серию из 70 матчей и пережил эмоциональные моменты в Юношеской лиге УЕФА. Защищал цвета юниорской национальной сборной, затем был основным игроком юношеской сборной и получил вызов во взрослую национальную сборную в августе 2020 на поединки Лиги наций.

Приглашен в первую команду ΠΑΟΚ в марте 2019, много работает над собственным улучшением, рассудителен, терпелив и возможности проявить его способности не заставят себя долго ждать. Он получил место в стартовом составе в заключительных матчах плей-офф сезона 2019-2020, показав превосходную игру. «Вишенкой на торте» стал его гол со штрафного в ворота ОФИ 4 июля 2020, благодаря которому ΠΑΟΚ сравнял счет 2-2. В нынешнем сезоне насчитывает 16 матчей во всех турнирах.