Малезас дебютировал в футболке ΠΑΟΚ 16.01.2006 в домашнем матче с «Ксанти», а до этого был арендован в команду «Иродотос».

В последующие три года ему удалось постепенно закрепиться в основе «Двуглавого», получить вызов в национальную сборную и попасть в ее состав на Чемпионат мира 2010 и Евро 2012.

Тем летом Малезас перешел в немецкую «Фортуну» Дюссельдорф, за которую выступал два сезона. Прошлым летом греческий футболист вернулся в Суперлигу, играя за «Панетоликос», а теперь снова оказался в ΠΑΟΚ.