Родился 1 сентября 1993 в Харлеме, Нидерланды в семье выходца из Нигерии и нидерландки. Свои первые шаги в футболе делал в «Овербосе», прежде чем поступить в колледж в Англии. Там он занимался в футбольных академиях клубов «Фулхэм» и «Тоттенхэм Хотспур».

В Англии он не выступал на профессиональном уровне, дойдя до второй команды «Тоттенхэма» и летом 2013 вернулся к себе на родину в «Гронинген». Там он сыграл два официальных матча и на вторую половину сезона был отдан в аренду в «Дордрехт», где и провел следующие 1,5 года.

Троост-Эконг сразу стал ведущим футболистом и во многом помог своему клубу выйти в элиту. В Эредивизи он также выступал в основе, насчитав в общем итоге 34 поединка.

«Дордрехт» снова вылетел во вторую лигу, и защитник подписал соглашение с бельгийским «Гентом», который сразу же отдал его в аренду в норвежский «Хёугесунн». В Норвегии он сыграл 41 матч, забил 4 гола и отдал 2 результативные передачи.

В сезоне 2016-17 вернулся в «Гент», принял участие в 8 матчах и летом 2017 оправился в Турцию.

Троост-Эконг подписал контракт с клубом «Бурсаспор» и провел там насыщенный сезон, записав в актив 32 поединка и 3 забитых мяча.

Выступления в Турции открыли ему дорогу в Серию А. «Удинезе» усилил им свою линию обороны, и футболист справился с обязанностями на отлично. За два сезона он провел 66 матчей, став основным и незаменимым.

В сентябре 2020 «Уотфорд» предоставил ему возможность вернуться в Англию, и он не упустил такой возможности.

Нигериец был ключевым игроком на пути к возвращению в Премьер-лигу, он сыграл 17 матчей в элитном дивизионе, однако вылет «Уотфорда» и внутренние изменения в клубе в сезоне 2022-23 заставили его искать новые приключения во второй половине игрового периода.

«Салернитана» дала ему шанс вновь сыграть в Серии А. В 9 матчах Эконг забил один гол и помог команде остаться в высшей лиге.

Нынешним летом защитник искал новый вызов в карьере. ΠΑΟΚ убедил его, выиграл конкуренцию и нигериец переезжает в Салоники на ближайшие три года.