Ο Μαλεζάς έκανε ντεμπούτο με τη φανέλα του ΠΑΟΚ στις 27.10.2005 στην εκτός έδρας αναμέτρηση με τον Αγροτικό Αστέρα για το Κύπελλο Ελλάδας κι αφού την προηγούμενη σεζόν είχε παραχωρηθεί δανεικός στον Ηρόδοτο.

Σταδιακά, τα χρόνια που ακολούθησαν κατάφερε να καθιερωθεί στο βασικό σχήμα του Δικεφάλου, να κληθεί στην Εθνική ομάδα και να συμπεριληφθεί στην αποστολή για το Μουντιάλ του 2010 και το Euro 2012.

Εκείνο το καλοκαίρι ο Μαλεζάς πήρε μεταγραφή στη γερμανική Φορτούνα Ντίσελντορφ στην οποία κι έμεινε για δύο χρόνια. Το  καλοκαίρι του 2014, ο Έλληνας ποδοσφαιριστής γύρισε στη Super League για λογαριασμό του Παναιτωλικού όπου και παρέμεινε για ένα χρόνο. Επέστρεψε στον ΠΑΟΚ για να επιβεβαιώσει ότι παραμένει μια αξιόπιστη και στιβαρή σταθερά για τα μετόπισθεν. Τη σεζόν 2017-18 ήταν εκ των τριών αρχηγών του ΠΑΟΚ, που ύψωσε στον ουρανό το δεύτερο συνεχόμενο Κύπελλο Ελλάδας για τον Δικέφαλο. Την επόμενη αγωνιστική περίοδο αναδείχθηκε αήττητος πρωταθλητής και νταμπλούχος με τον ΠΑΟΚ και το καλοκαίρι αποχώρησε για την Ξάνθη.

Αγωνίστηκε για μία περίοδο στην ακριτική ομάδ